Binnen de vakgroep Medische oncologie zijn we op zoek naar een gedreven postdoc met aantoonbare kennis in kanker-genomics, voor de uitvoering en ondersteuning van translationeel kankeronderzoek, binnen de afdelingen Medische Oncologie en Humane Genetica.

Next-generation sequencing (NGS) van circulerend tumor DNA (ctDNA) is een toepassing om inzichten te krijgen in het moleculaire profiel van kankerpatiënten, een behandelrespons te kunnen uitmeten, en te bepalen of er residuale ziekte is na eerdere curatieve behandeling. Voordelen van het gebruik van ctDNA boven dat van gearchiveerd weefsel, is dat de bepalingen mogelijk zijn met een non-invasieve (bloed- of urine)test, waarbij het huidig tumor-genetisch profiel kan worden geanalyseerd, inclusief aanwezigheid van tumorklonaliteit. Met behulp van longitudinale analyses kunnen ook inzichten verkregen worden in resistentiemechanismen en tumorevolutie.

Voor dit project zijn wij op zoek naar een postdoc die werkzaamheden verricht naar de toepasbaarheid en implementatie van ctDNA-bepalingen met zeer gevoelige NGS-technologieën (hybrid based capture sequencing). De werkzaamheden zullen worden uitgevoerd op de afdelingen Genetica, in nauwe samenwerking met de afdeling Medische Oncologie.

Je participeert binnen de bovengenoemde afdelingen, en binnen het ‘Liquid Biopsy Group’, in projecten waar ctDNA is verzameld is voor onderzoek. Primair zal er gewerkt worden met biomateriaal vanuit de PROMPT-studie, een prospectief cohort van prostaatkanker patiënten, waar van >500 patiënten biopten en longitudinaal ctDNA is verzameld. We hopen vanuit deze dataset inzichten te krijgen of ctDNA-testen snel in de kliniek voor prostaatkanker patienten kunnen worden ingezet. Daarnaast zijn er andere cohorten/datasets beschikbaar; PRECISE, prospectief cohort met longitudinaal ctDNA in urotheelcarcinoom, melanoom, en niercelcarcinoom; PMSA-lutetium studie ‘Bullseye2’, een recent afgeronde fase 2 studie met longitudinale ctDNA-verzameling; PROSPER-MRD, een project waar perioperatief ctDNA wordt verzameld bij hoog-risico gelokaliseerd prostaatkanker.

Tevens is er ruim de mogelijkheid om nieuwe (eigen) projecten te initiëren. Het ultieme doel zal zijn om ctDNA NGS-technieken te implementeren in de diagnostiek, die erop gericht is de behandeling van patiënten met kanker op basis van deze ctDNA-metingen te optimaliseren.

Taken en verantwoordelijkheden

• Zelfstandig plannen en uitvoeren van experimenten.
• Analyseren van NGS-data en optimaliseren van de bioinformatische pipeline voor geautomatiseerde analyse.
• Supervisie van analisten, en junior wetenschappers (MSc, promovendus).
• Rapportage van onderzoeksresultaten naar consortiumpartners van lopende projecten.
• Leidende rol bij het schrijven van manuscripten.
• Presenteren van data op lokale, nationale en internationale wetenschappelijke bijeenkomsten.
• Schrijven van aanvragen ten behoeve van financiële ondersteuning van vervolgonderzoek.

Je hebt een passie voor translationeel toegepast onderzoek en werkt graag in een multidisciplinair team van clinici, laboratoriumspecialisten, klinische genetici, klinisch moleculair biologen in de pathologie, analisten en onderzoekers. Als proactieve, krachtige en oplossingsgerichte bruggenbouwer beschik je over uitstekende sociale vaardigheden en people management skills.

Daarnaast herken je jezelf in onderstaand profiel:

• Gepromoveerd of in een afrondende fase van het schrijven van je proefschrift op een moleculair biologisch of genetisch onderwerp.
• Een achtergrond in genomics, bij voorkeur op het gebied van oncologie.
• Ervaring in next-generation sequencing technieken en de daarbij horende data-analyse.
• Een kritisch wetenschappelijke houding en het vermogen om op gestructureerde wijze te werken met grote datasets.
• Ervaring met bioinformatica en statistische analyses.
• Mondeling en schriftelijk communicatief vaardig, zowel in het Nederlands als in het Engels.

Dienstverband voor bepaalde tijd: 1 jaar met uitzicht op verlenging.

Bij het Radboudumc bouw je aan de toekomst. We gaan voor de beste zorg, onderwijs en onderzoek. Dat maken we waar omdat je je bij ons ontwikkelt, kansen pakt en ruimte voelt om op te staan. Als werkgever vinden we het belangrijk dat medewerkers binnen alle levensfasen vitaal en met plezier aan het werk zijn. Dit in een gezonde en veilige omgeving. Onze arbeidsvoorwaarden mogen er ook zijn. Zo kun je rekenen op:

• Een bruto maandsalaris tussen € 3.493 en € 5.504 (schaal 10) bij een fulltime dienstverband (36 uur per week). Ook krijg je 8% vakantiegeld, 8,3% eindejaarsuitkering en, als dat voor je functie geldt, een onregelmatigheidstoelage van 47% tot 72%.
• 172 vakantie-uren per jaar op basis van een 36-urige werkweek. (Per 1 januari 2025 krijg je 176 vakantie-uren).

Radboudumc

De afdeling Medische Oncologie is onderdeel van het Radboud Centrum voor Oncologie. Multidisciplinair werken staat hier hoog in het vaandel. Dit geldt zowel voor de patiëntenzorg als de research. De verpleegafdeling, dagbehandeling en polikliniek zijn geïntegreerd om een goede stroomlijning in de behandeling voor onze patiënten te waarborgen. Er is extra aandacht voor adolescenten en jong volwassenen (AYA) met kanker, maar ook voor ouderen oncologie. Ingebed in patiëntenzorg vindt vroeg klinisch onderzoek, alsmede farmacologisch, pathologisch, genetisch en imaging gestuurd onderzoek plaats. Er is een nauwe relatie met het Laboratorium Tumorimmunologie.

Binnen de afdeling Medische Oncologie zijn momenteel 14 stafleden werkzaam (deels parttime verbonden aan onze afdeling). Enthousiaste en betrokken fellows, arts-onderzoekers en studenten dragen bij aan het onderwijs- en opleidingsklimaat van de afdeling.

De afdeling Genetica is één van de grootste en meest innovatieve genetica afdelingen van Europa. Momenteel hebben we meer dan 300 medewerkers in dienst, die actief samenwerken in drie divisies: klinische genetica, genoomdiagnostiek en genoomresearch. Op het gebied van de oncologie wordt daarnaast nog nauw samengewerkt met de afdeling Pathologie binnen het Laboratorium Tumor Genetica. Deze integratie van wetenschappelijke expertises in moleculaire, pathologische en medische wetenschappen heeft er toe geleid dat reeds vele technische innovaties vertaald zijn naar routine diagnostische toepassingen.

Het Radboudumc streeft naar excellentie in alle academische taken, maar streeft er ook naar om de patiënt een belangrijke stem in het behandelteam te geven. Samenwerking binnen netwerken en partnerships zijn actuele Radboud thema’s om een optimale organisatie van oncologische zorg duurzaam vorm te kunnen geven.

De individuele patiënt is altijd het middelpunt van zorg in het Radboudumc. Unieke kenmerken zijn de genetische achtergrond en de individuele tumorbiologie. De afdeling Medische Oncologie streeft naar een gepersonaliseerde anti-kankerbehandeling voor zijn patiënten met kanker; we streven ernaar de stratificatie van patiënten te verbeteren voor gerichte therapie en immunotherapie door een optimale behandeling te matchen op basis van de persoonsgerichte (DNA/eiwit) analyse resultaten in het kader van multidisciplinaire moleculaire-tumorbesprekingen (MTB). We proberen ook om de vroege responsbeoordeling verder te optimaliseren en de vroege detectie van ziekterecidief te verbeteren, op een niet-invasieve manier in celvrij circulerend tumor-DNA, met behulp van seriële bloedtesten.

Het Radboudumc
Onze missie is: to have a significant impact on health and healthcare. We willen vooroplopen bij de ontwikkeling van duurzame zorg: zorg die mens en milieu zo gezond mogelijk houdt, zinnig en betaalbaar is, en liever voorkomt dan geneest. Zorg die er ook nog is voor de kinderen van onze kinderen. Dat doen we in alle drie onze kerntaken: zorg, onderwijs en onderzoek. We werken innovatief, persoonsgericht en samen met anderen in netwerken.

Benieuwd of deze functie bij je past? Of hoe het is om bij het Radboudumc te werken? Bel, Whatsapp of mail dan met dr. Niven Mehra, internist-oncoloog via 06 15 21 46 24. Voor solliciteren gebruik de knop ‘solliciteer’.