De 'Archipelago of Ovarian Cancer Research' (AOCR) heeft als doel om de diagnostiek, behandeling en overleving van patiënten te verbeteren. Deze recent opgerichte landelijke biobank gaat wetenschappelijk onderzoek naar ovariumcarcinoom in Nederland faciliteren en dit naar een hoger plan brengen. Dit unieke project wordt ondersteund door een subsidie van het KWF.
Het project draait inmiddels enkele jaren en een groot deel van de benodigde IT-infrastructuur is in die tijd in kaart gebracht en opgezet. Recent is de koppeling tussen Ldot en de externe registers PALGA en IKNL gerealiseerd, waardoor we nu een nieuwe fase ingaan met, onder meer, veel ETL-werkzaamheden. Daarnaast moet ook Open Specimen, de IT-oplossing voor de registratie van samples van alle deelnemende centra, nog worden opgezet. Hier ligt een schitterende uitdaging.
Wat ga je doen?In het bijzonder houd je je op het gebied van het opzetten van de IT-infrastructuur bezig met:
- Inrichten van Open Specimen voor de opslag van biobank data uit deelnemende centra.
- Harmoniseren van biobank data van deelnemende centra voor upload naar Open Specimen.
- ETL-werkzaamheden, zoals scores vanuit Slide Score beschikbaar maken in Castor EDC.
- Onderhouden/aanpassen van reeds opgezette oplossingen, zoals bijvoorbeeld het testen van nieuwe releases van Slide Score en aanpassen van formulieren in Castor.
- Onderhouden/bouwen van Python scripts die bovengenoemde activiteiten makkelijk/mogelijk maken.
- Onderhouden van contact met verscheidene externe partijen, waaronder Ldot, IKNL en PALGA.