Promovendus bij Infectieziekten

Patiënten op de Intensive Care (IC) hebben vaak verstoorde darmflora (‘microbioom’) en een verminderde darmbarrière. Dit kan leiden tot een verstoorde immuunrespons, een verhoogd risico op infecties en overlijden tijdens IC-opname, maar ook in de periode daarna. Het toedienen van levende bacteriën als probiotica heeft bij ernstig zieke patiënten tot nu toe niet geholpen, en kan zelfs gevaarlijk zijn. In ons recente onderzoek lijkt de darmbacterie Akkermansia muciniphila ook in geïnactiveerde vorm een positief effect op de darmbarrière te hebben, en zou daarom mogelijk een veilig alternatief zijn.

In dit project willen we onderzoeken of toediening van geinactiveerde Akkermansia muciniphila de darmbarrierefunctie kan verbeteren, de samenstelling van het microbioom kan beïnvloeden, en het herstel na een IC opname kan bespoedigen. Hiervoor zullen we eerst een miniatuurdarm (organoid) model gebruiken om de beste Akkermansia variant te selecteren. Daarna gaan we een gerandomiseerde placebogecontroleerde studie uitvoeren om de geselecteerde geïnactiveerde Akkermansia te testen bij 40 patiënten die recent van de IC zijn ontslagen. Dit zal leiden tot klinisch en wetenschappelijk relevante informatie over de rol van het microbioom (en specifiek geinactiveerde Akkermansia) in het herstel na IC-opname.

Als promovendus coördineer je dit translationele onderzoek en voer je onder andere de volgende werkzaamheden uit:

• Het testen van verschillende geïnactiveerde Akkermansia varianten in een darm organoid model met als doel de optimale stam te selecteren.
• Het opzetten en coördineren van een klinische studie om het effect van orale toediening van geïnactiveerde Akkermansia muciniphila te testen bij patiënten na ontslag van de IC. Je bent medeverantwoordelijk voor de dagelijkse uitvoering van de studie en zal de verzamelde samples en data analyseren.
• Het schrijven van verschillende wetenschappelijke publicaties die worden gecombineerd in een proefschrift.

Je komt te werken op de afdeling Center for Experimental and Molecular Medicine (CEMM) van Amsterdam UMC, locatie AMC. Dit is een multidisciplinaire onderzoeksgroep bestaande uit internisten (in opleiding) bio-medici, arts-onderzoekers, researchverpleegkundigen, laboratorium analisten en studenten. Tijdens je onderzoek werk je nauw samen met je collega’s van de Intensive Care en het CEMM. Je zult werken onder de directe supervisie van Dr. Bas Haak en Prof. Joost Wiersinga.

Op het CEMM wordt toonaangevend translationeel onderzoek gedaan naar onder andere sepsis, pneumonie en COVID-19. Wekelijks hebben de onderzoeksteams overleg en regelmatig zijn er onderzoeksbesprekingen waarin nieuwe projecten en behaalde resultaten worden besproken. Het onderzoek is veelal gefinancierd door prestigieuze beurzen en de studieresultaten worden in hoog aangeschreven tijdschriften gepubliceerd. Ook is er de gelegenheid congressen over het onderwerp van onderzoek te bezoeken. De cultuur is ontspannen, open en collegiaal, gekenmerkt door veel samenwerkingen, zowel tussen de verschillende onderzoeksgroepen als (inter)nationaal.